内蒙古自治区档案局（馆）共有事业单位3个。
    一、 内蒙古自治区档案局（馆）
    内蒙古自治区档案局（馆）为自治区党委办公厅直属的相当于正厅级事业单位。内设处级机构11个：办公室、人事教育处（机关党委）、法规处、档案馆室业务监督指导处、经济档案业务监督指导处、收集整理部、蒙文档案部、科技部（对外挂技术服务中心的牌子）、信息技术处、保管利用部、编目编研部（挂自治区档案研究所的牌子）。核定事业编制107名。核定厅级领导职数4名（1正，3副），处级领导职数27名（12正，15副）。经费形式为全额拨款。
    二、 内蒙古自治区档案局机关事务服务中心
    内蒙古自治区档案局机关事务服务中心为内蒙古自治区档案局（馆）所属的相当于副处级事业单位。内设科级机构3个：管理科、保卫科、车队。核定事业编制15名。核定处级领导职数1名（1副），科级领导职数4名（4正）。经费形式为全额拨款。
    三、 内蒙古自治区档案教育与研究中心
    内蒙古自治区档案教育与研究中心为内蒙古自治区档案局（馆）所属的相当于正处级事业单位。内设科级机构2个：办公室、教学管理科。核定事业编制10名。核定处级领导职数2名（1正，1副），科级领导职数2名（2正）。经费形式为全额拨款。